努比亚山羊PDK4基因克隆、序列分析及表达水平研究

作者：蔡沛燃; 邹菊红; 胡艳; 张叁保; 宋颖; 蒋钦杨^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2022, (09): 55-141.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.07.0235

• 努比亚山羊
• 都安山羊
• PDK4基因
• 克隆
• 生物信息学

为了探究努比亚山羊PDK4基因的脂质代谢途径，试验以40～48周龄努比亚山羊为研究对象，取其心脏、肾脏、肝脏、脾脏、背最长肌及皮下脂肪等组织/器官，分别提取总RNA,将其反转录为cDNA,采用PCR方法扩增PDK4基因片段，利用生物信息学软件分析PDK4基因序列，通过实时荧光定量PCR方法检测努比亚山羊不同组织/器官内PDK4基因的表达情况，同时以都安山羊为对照。结果表明：通过克隆成功获得努比亚山羊PDK4基因的CDS片段，其长度为1 224 bp,共编码407个氨基酸残基；PDK4基因核苷酸序列与GenBank中的绵羊、牛、欧亚猪、马、人、小鼠的同源性分别为99.3%、97.6%、93.0%、92.5%、91.0%、85.0%;努比亚山羊PDK4蛋白氨基酸组成中亮氨酸含量较高，占总氨基酸数的10.8%,属于亲水性蛋白；努比亚山羊PDK4蛋白大部分是由α-螺旋和无规则卷曲组成，少部分由延伸链和β-转角组成。此外，努比亚山羊皮下脂肪中PDK4基因相对表达量最高，与其他组织比较差异显著(P<0.05),且心脏中PDK4基因相对表达量最低；努比亚山羊皮下脂肪中的PDK4基因相对表达量显著高于都安山羊(P<0.05)。说明PDK4基因可作为研究努比亚山羊脂肪沉积的主要候选基因之一。

• 单位
  广西大学