红肉枇杷(Eriobotrya japonica)伸展蛋白基因家族的全基因组鉴定与分析

作者：杨玉盈; 陈文博^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(01): 1-16.

DOI：10.13271/j.mpb.021.000001

• 枇杷
• 伸展蛋白
• 基因家族
• 生物信息

伸展蛋白(extensin, EXT)属于富含羟脯氨酸的糖蛋白(hydroxyproline-rich glycoprotein, HRGP)的一类，是细胞壁中的一种结构蛋白，在植物的生长中发挥多种作用。本研究在枇杷基因组中进行了EXT基因家族的全基因组鉴定，从所有枇杷蛋白编码基因中鉴定到112个EXT序列。根据结构域的类型、特征基序的数量和信号肽的有无，将112个EXT序列分为8类，包括6个经典的EXT (classical EXT, CEXT)、8个formin同源EXT (formin homolog (FH) chimeric EXT, FH EXT)、6个富含亮氨酸重复序列的嵌合EXT (leucine-rich repeat (LRR) chimeric EXT, LRX)、14个富含脯氨酸的EXT类受体激酶(proline-rich EXT-like receptor kinase,PERK)、9个短EXT (short EXT, SEXT)、1个长嵌合EXT (long chimeric EXT, LEXT)、56个其他嵌合EXT (other chimeric EXT, OEXT)和12个潜在EXT (potential EXT, PEXT)。并通过保守基序分析和基因结构可视化表明具有相同分类的EXT保守基序和基因结构相似，顺式调控元件分析表明EXT家族可能在多种植物激素响应和逆境胁迫中发挥重要作用，共线性分析进一步阐明了EXT基因家族的扩增可能是由于全基因组复制事件的发生。本研究为枇杷EXT家族基因分子功能的研究提供了一个参考的方向。

• 单位
  浙江大学