白纹伊蚊感染登革病毒后病毒特异性piRNAs分析

作者：赖植发; 王衍海; 顾金保; 陈晓光

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2014, 28(04): 277-279.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2014.04.012

• 登革热病毒
• 伊蚊属
• RNA

目的筛选并分析白纹伊蚊感染登革病毒后病毒特异性vsRNAs与vpiRNAs。方法白纹伊蚊羽化后24 d雌性成蚊显微注射DENV-2病毒NGC株,对照组注射生理盐水。8 d后提取样品总RNA,分离小RNA,通过illumina Hiseq 2000测序仪进行测序分析。以SOAP2软件与DENV-2基因组和互补序列进行比对。对病毒特异性的vsRNAs与vpiRNAs的长度、碱基与链偏好性、基因组分布进行分析。结果对于感染蚊虫,我们共计获得3835个特异的DENV-2来源的vsRNAs,其中395个特异性的vpiRNAs。94.99%vpiRNAs主要来源于病毒的正链基因组。vpiRNAs在DENV-2基因组上的分布也具有偏向性,最高峰位于病毒非结构蛋白NS5编码区域的3′末端。第10位碱基具有较强的腺嘌呤偏好性,但第1位碱基不具有尿嘧啶偏好性;也无典型"乒乓"扩增循环的特征。结论白纹伊蚊感染登革病毒后,体内出现病毒特异性vsRNAs与vpiRNAs,对其鉴定与分析将为在白纹伊蚊抗病毒免疫研究提供理论基础。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 南方医科大学; 深圳市福田区疾病预防控制中心