胃腺癌肿瘤微环境中基质和免疫相关预后基因的鉴定

作者：费习昌; 彭瑶; 张明军^*

来源：现代消化及介入诊疗, 2022, 27(11): 1436-1442.

• 胃腺癌
• 肿瘤微环境
• 预后
• TCGA

目的 基于ESTIMATE算法探讨胃腺癌(Stomach adenocarcinoma, STAD)肿瘤微环境中基质评分和免疫评分与STAD患者的预后和临床特征相关性，并提出了几个与肿瘤微环境相关的STAD预后生物标志物。方法 我们使用来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库的数据和ESTIMATE算法评估了STAD的基质和免疫评分，评价评分与STAD患者预后和临床特征的关系。根据评分获得差异表达基因，并鉴定预后相关基因。功能富集分析和蛋白互作网络(PPI网络)进一步揭示这些基因参与的生物学过程。结果 基质评分与STAD患者的预后相关，基质及免疫评分均与临床特征相关。通过基质和免疫评分识别出241个共同差异基因，组建出一个PPI网络，同时进行单变量Cox回归分析。接下来对PPI网络中的核心节点基因与上述单变量Cox回归分析获取的显著性基因交叉分析，获得11个与STAD患者生存相关的基因，分别是：MPO,DPT,IGHD3-16,ELANE,AC110995.1,BPI,FAM216B,OGN,PTGDS,IGHJ1,IGLC5。我们选择其中三个关键基因(MPO,ELANE和BPI)进行单基因分析，并阐明它们与临床病理特征的关系。结论 肿瘤微环境的基质和免疫评分与STAD患者的预后及临床特征相关，我们确定了11个可能与肿瘤微环境相关并影响STAD患者预后的基因(MPO,DPT,IGHD3-16,ELANE,AC110995.1,BPI,FAM216B,OGN,PTGDS,IGHJ1,IGLC5),其中MPO、ELANE和BPI可能是STAD潜在的预后标志物和治疗靶点。

• 单位
  安徽医科大学第二附属医院