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摘要
黑果枸杞果实中富含花青素，为探究黑果枸杞和白果枸杞的基因表达差异，挖掘控制黑果枸杞黑果性状的主效基因，本研究利用RNA-Seq技术对黑果枸杞和白果枸杞进行转录组测序与生物信息学分析。结果表明，黑果枸杞和白果枸杞中共检测到25 279个基因差异表达，其中12 381个基因在黑果枸杞表达上调，12 898个基因表达下调。KEGG富集结果显示，共有571个差异表达基因参与植物次生代谢产物合成，尤其是在黄酮类和花青素生物合成代谢通路中差异最为明显。黑果枸杞中共有8个参与花青素合成代谢的结构基因的表达量均高于白果枸杞，说明花青素的生物合成可能与黑果枸杞黑果性状相关。调控花青素生物合成的bHLH转录因子CL8159.Contig5＿All的表达水平比白果枸杞增强了2 139.57倍，这个基因很有可能是控制黑果枸杞黑果性状的候选基因。本研究筛选到控制黑果枸杞花青素合成代谢的候选基因，为黑果枸杞的分子遗传机理及进一步的基因功能研究提供了依据。
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