摘要
为了解拟南芥中AMAR1及其旁系同源蛋白的蛋白特征,并分析它们在生长和逆境中的表达情况,本研究通过生物信息学和qPCR等方法对AMAR1家族蛋白特征及其表达特征。首先通过生物信息学分析在拟南芥中共鉴定了AMAR1的17个旁系同源蛋白(Paralogs),并将其命名为AMAR1家族蛋白。AMAR1家族被分为两类:I类包括4个成员;II类分为两小类:IIa和IIb,IIa包括5个成员;IIb包括9个成员。大多数AMAR1家族蛋白定位在叶绿体中,其中5个(AT1G15490, AT3G55880, AT1G52750, AT2G40095和AMAR1)具有典型的跨膜结构域。在这18个基因启动子区中,大多数含有脱落酸和光响应元件。结合转录组数据和qPCR分析发现,多个AMAR1基因家族成员参与非生物与生物胁迫响应应答。其中AT5G19850、AT2G26750、AT2G26740、AT4G37150、AT5G38520和AT4G24160在多种非生物胁迫处理时表达上升。但AMAR1、AT3G10840、AT4G12830、AT5G38520、AT3G05600和AT1G15490等6个基因在多种非生物胁迫时表达下降。病原细菌接种后AT2G40095、AT3G55880、AT4G24160、AT2G26740、AT1G74640、AT2G26750、AT4G37150和AMAR1的表达量显著上升,参与植物的防御响应。以上结果表明AMAR1家族蛋白参与多种胁迫应答响应,在拟南芥应对逆境和抵抗病原菌入侵过程中起重要作用。本研究为进一步探索α/β水解酶家族在植物生长发育、胁迫应答中的作用提供理论基础。
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