医院要提高运营效率,需要科学的评价方法提供决策支持。近年来,国内外广泛应用传统数据包络分析方法对医院效率进行综合评价,取得了大量的应用研究成果,但利用广义数据包络分析方法对医院效率进行评价的文献还未查到。故本文选择了内蒙古14所三甲医院的指标数据,分别采用传统数据包络分析方法和广义数据包络分析方法得到了14所三甲医院的相对效率值,通过对比分析,得到了广义数据包络分析方法在评价医院综合效率中相比于传统数据包络分析方法的显著优势。