玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析

作者：路媛媛; 孙承龙; 谭玉琴; 魏文杰; 史咸春; 宋艳波; 李丽; 刘振宇^*

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2022, 42(02): 56-64.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.202111016

• 玉蜀黍尾孢菌
• VelB
• 生物信息学
• 敲除载体
• 敲除突变体

[目的]通过对玉蜀黍尾孢菌VelB基因进行生物信息学分析并构建敲除载体，为研究CzVelB调控玉蜀黍尾孢菌致病性的分子机制奠定基础。[方法]从JGI数据库中获得CzVelB基因序列，对其进行生物信息学分析，包括蛋白质的性质、保守区域、磷酸化位点、亚细胞定位、跨膜结构域和聚类分析，分析其基因功能。并采用同源互补原理构建CzVelB基因敲除载体，最终采用农杆菌介导遗传转化技术进行基因敲除。[结果]CzVelB基因编码385 AA，预测pI和MW分别为9.05和42.136 45 kDa，是亲水性蛋白，无跨膜结构域。在亚细胞水平上，CzVelB定位在细胞核中。在氨基酸序列方面，具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点；在功能上具有2个Velevt的保守结构域，并与Aspergillus flavus、A. niger亲缘关系较近，具有较高同源性。根据CzVelB基因序列设计特异性引物，扩增侧翼片段和标记基因，分别连入骨架载体pPZP100中，成功构建CzVelB基因的敲除载体，最终利用ATMT技术获得其敲除转化子。[结论]本文系统研究玉蜀黍尾孢菌VelB基因功能，并成功构建其敲除载体，获得敲除转化子，为后续研究CzVelB基因功能提供基础材料。

• 单位
  山西农业大学; 生命科学学院