野生小鼠群体和实验室小鼠品系线粒体基因组序列的比较分析

作者：靖美东; 王有铭; 姚珂莹; 黄玲^*

来源：南通大学学报(医学版), 2022, 42(05): 402-408.

DOI：10.16424/j.cnki.cn32-1807/r.2022.05.002

• 野生小鼠
• 实验室品系
• 线粒体全基因组
• 比较分析

目的：对192只野生小鼠样品及126只实验室小鼠样品的线粒体全基因组序列进行比较研究，解析小鼠野生群体及实验室品系之间线粒体基因组的遗传差异。方法：利用生物信息学方法比较野生小鼠群体和实验室小鼠品系线粒体基因组多态性，密码子使用及演化速率的差异。结果：现有实验室小鼠品系的线粒体基因组多态性远小于野生群体；小鼠野生群体和实验室品系的线粒体基因组之间已经积累了显著的遗传差异，而且不同功能分类的序列分歧程度有差异；虽然12个在重链表达的蛋白质编码基因(protein coding genes, PCGs)的碱基组成在野生群体和实验室品系间非常相似，但是密码子使用频率显著不同；12个PCGs在野生群体和实验室品系中都经历纯化选择，但是不同的实验室单倍型序列中非同义突变率(Ka)、同义突变率(Ks)及其比值(Ka/Ks)变化趋势不同，提示在实验室品系培育过程中线粒体基因组的演化机制比较复杂。结论：野生小鼠群体和实验室小鼠品系线粒体基因组序列的比较分析有助于更全面地了解小鼠实验室品系培育过程中线粒体基因组的演化差异。

• 单位
  南通大学; 生命科学学院