依据学术界共识，将清朝划分为前期、中期和后期。尝试通过五运六气学说，对周扬俊、余师愚、陈虬等清代治疗瘟疫有特色的医家的学术思想进行分析研究。基于“大司天”“小司天”“三年化疫”理论及《黄帝内经》的“五疫”理论，论述不同医家所处时期疫病发生时的运气特点，并对医家治疗疫病的认识进行分析。旨在借助五运六气理论，揭示清代主要疫病的发病机理以及医家治疫的立法思路、异同，论证运气学说对于疫病的诊治的重要性，以求更好地传承清代医家治疗疫病的经验，实现古为今用。
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