细胞膜通透性的改变,使抗生素不能,或很少透入细菌体内到达作用靶位;灭活酶或钝化酶的产生,如产生β内酰胺酶,使抗生素失效;与抗生素结合靶位(亲和力)的改变,使抗生素的作用下降;其他,如主动外排系统(泵出机制)等。其中由β-内酰胺酶介导的耐药性迅速发展,几乎是每种新的β内酰胺抗生素刚刚在治疗中使用,便会有新的能水解该抗生素的β内酰胺酶出现。