我国部分地区HIV-1流行毒株亚型分布及gag基因变异特征研究

作者：陈立力; 刘永健; 李韩平; 鲍作义; 庄道民; 刘思扬; 王铮; 赖章丽; 李林; 李敬云

来源：军事医学科学院院刊, 2009, (06): 505-508.

• 人类免疫缺陷病毒1型
• gag基因
• 基因型
• 遗传变异 human imunodeficiency virus-1
• gag gene
• genotype
• genetics variation

目的:分析我国4个地区的人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)主要流行毒株的亚型分布,以及在宿主免疫压力下的基因变异和抗原表位的变化情况,初步探讨这些地区HIV-1gag基因的分子进化特征。方法:从来自河南、广东、四川、北京的HIV-1感染者血浆样本中提取基因组RNA,经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增部分gag基因,用扩增产物直接进行测序;使用Genotyping Tool软件进行亚型分析,使用MEGA4.1软件绘制系统进化树;用Distance工具计算各个亚型序列的基因离散率;用SNAP程序分析同义替换率与非同义替换率的比值(Ks/Ka),并对各亚型中我国人群中较常见的HLA-Ⅰ型限制的...

• 单位
  兰州军区乌鲁木齐总医院; 军事医学科学院; 病原微生物生物安全国家重点实验室