农民合作社是农民提升农业生产效率的重要合作组织，对我国农业发展具有重要意义。基于对新疆地区棉花种植农户的实地访谈所得数据，对棉农加入合作社的影响因素通过二元Logit模型进行实证分析。研究发现户主年龄、受教育程度、是否担任（过）干部、棉花种植面积、种植年限、市场价格波动程度、棉花收入比重和劳动力投入比重等因素对棉花种植户加入合作社行为有显著影响。基于上述结论，提出应鼓励农户专业化种植、发展能使农业合作社进步的先锋带头人、加大对合作社的支持推广力度等政策建议。
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