‘蜂糖李’全长转录组测序分析及糖代谢相关基因挖掘

作者：王红林; 马玉华; 解璞; 张敏; 彭志军; 郑乾明^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-17.

• 蜂糖李
• 全长转录组
• 功能注释
• 糖代谢基因

分析‘蜂糖李’全长转录本序列和结构信息，挖掘其糖代谢相关基因，为进一步研究‘蜂糖李’果实糖代谢分子机制提供科学依据。以‘蜂糖李’的花、叶、茎和果实为试材开展混合样品三代全长转录组测序，获得‘蜂糖李’高质量转录本序列53 015条，平均长度为2 364.84 bp；预测获得编码序列(Coding sequence， CDS) 52 587条，平均长度1 590.40 bp；在公共数据库中有50 833条转录本被注释，占95.88%；其中，在NR数据库中被注释的转录本数量最多，有50 716条，占95.66%，匹配到的物种主要是杏、梅和桃，分别占28.61%、27.86%和19.16%；其次是Uniprot数据库中比对的结果，占95.65%，而KOG数据库中比对到的数量最少，为6 838条，占12.90%；糖含量检测结果显示，成熟‘蜂糖李’果实糖含量较‘四月李’等其他几个供试样品的糖含量高，且蔗糖含量显著高于葡萄糖、果糖和山梨醇，结合KEGG代谢通路富集分析获得12个糖代谢相关基因、对应的转录本数量为49条。这为后期研究‘蜂糖李’糖代谢分子机制提供了一定的理论基础。

• 单位
  贵州省农业科学院