生物信息学的产生标志着生物学研究模式的变革,其本科课程的建设倍受关注。目前,生物信息学课程建设的主流思想是注重实践,引入诸如案例式教学、问题式教学或任务驱动式教学等新型教学模式。然而,生物信息学作为一个学科本身,具有强烈的理论内涵和普遍规律。本文强调了传统课堂在传授这些知识方面的不可替代作用,并举例说明了其中应讲授的基本思想和基础概念。最后,这里提出,注重理论和简单实践的导论性课程和注重实践的新型课程应分开建设,并同样重视。