金黄地鼠颊癌差异表达基因谱的构建及相关生物信息学分析

作者：梅杰; 杨凯; 张国栋; 张福军; 陈丹; 陈睿

来源：重庆医科大学学报, 2010, (12): 1782-1786.

DOI：10.13406/j.cnki.cyxb.2010.12.034

• 金黄地鼠
• 颊黏膜
• 癌变
• 全基因表达谱
• 生物信息学 Golden hamster
• Cheek pouch mucosa
• Carcinogenesis
• Entire gene expression profile
• Bio-informatics

目的:构建二甲基苯并蒽(9,10-Dimethylen-1,2Benzanthracene,DMBA)诱导金黄地鼠颊囊黏膜癌变过程中基因差异表达谱,用相关生物信息学分析方法筛选在癌变过程中起重要作用的基因和信号通路。方法:用DMBA诱导建立金黄地鼠颊鳞癌模型,以Ratio≥2和Ratio≤0.5为阈值,用Agilent全基因表达谱芯片检测金黄地鼠颊囊黏膜癌变的差异表达基因,并对这些差异基因进行(Gene ontology,GO)功能分类和Pathway通路分析。结果:金黄地鼠正常颊黏膜和癌变组织之间共有1 943条差异表达基因,其中上调基因787条,下调基因1 156条;GO分析差异表达基因涉...

• 单位
  重庆医科大学附属第一医院; 重庆医科大学