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摘要
高等植物的叶绿体基因组主要遗传自母本，具有基因组小、结构简单、序列高度保守等特点.利用系统的生物信息学方法，对4种藜属植物的叶绿体基因组进行编码基因组成、基因组结构、重复序列、变异位点在内的比较基因组学研究，以及基于叶绿体基因组序列的藜亚科植物的系统进化研究.结果表明，4种藜属植物叶绿体基因组平均大小为151936bp，平均GC含量为37.16%，具体基因的拷贝数和总的基因数目差异很小，非常保守.除灰绿藜以外，其余3种藜属植物叶绿体基因组的LSC、SSC和IR区域的边界几乎完全一致，没有表现出明显的扩张与收缩.基因组的重复序列中，相较于SSR，长重复序列片段的比例更高.相比较IR区域，4种藜属植物的LSC和SSC区域之间存在更大的核苷酸位点差异；52-59 kb的基因组区域为4种藜属植物间核苷酸位点变异最大的区段.基于全基因组和LSC+SSC序列，分别构建了包括4种藜属植物在内的藜亚科植物的系统进化树，进化关系完全一致.本研究结果揭示了藜属植物叶绿体基因组的进化特征，可为藜属植物系统进化研究提供优良的候选分子标记.（图4表4参28）
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