适用于转录组测序的大蒜花器官总RNA的提取方法

作者：陈雅楠; 尚云涛; 范宝莉^*; 刘晓颖; 曹宝鑫; 王振英

来源：天津师范大学学报（自然科学版）, 2020, 40(01): 34-39.

DOI：10.19638/j.issn1671-1114.20200107

• 大蒜
• 花器官
• RNA提取
• 改进酸性异硫氰酸胍法
• 转录组测序

为获得高质量的大蒜花器官RNA以用于后续花发育相关基因的研究,以大蒜中多糖多酚含量高的鳞茎为初步实验材料,采用2种试剂盒方法、CTAB法、Trizol法以及改进酸性异硫氰酸胍法提取总RNA,并对提取效果进行比较,筛选出能够得到高质量RNA的天根试剂盒方法和改进酸性异硫氰酸胍法.将改进酸性异硫氰酸胍法进一步用于提取大蒜花器官总RNA,相较于试剂盒方法,获得了质量更好、收率更高的RNA.对提取的大蒜花器官RNA进行完全测序,得到的clean reads占总raw reads比例大于98%,能够满足转录组测序分析的要求.

• 单位
  生命科学学院; 天津师范大学