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摘要
本研究通过转录组测序技术研究猪链球菌(Streptococcus suis)经H2O2处理后的全基因组转录水平变化，探究氧胁迫下与猪链球菌应对氧化应激过程相关的代谢通路和基因。将9型猪链球菌DN13菌株培养至对数生长后期，用PBS和H2O2分别处理15 min,将处理后的DN13菌株进行转录组测序(RNA-seq),对转录本中的差异表达基因进行KEGG和GO分析，并用实时定量PCR(real-time quantitative PCR, RT-qPCR)验证RNA-seq的分析结果。RNA-seq结果显示，DN13共检测到2 005个基因，与对照组相比，实验组有749个基因差异表达，占比37.4%。GO富集结果表明，差异表达基因在分子功能、生物学过程和细胞组分这3大类中均显著富集。KEGG富集结果表明，差异表达基因主要集中在核糖体、 ABC转运体、氨基糖和核苷酸糖的代谢以及半乳糖代谢等代谢途径中。RT-qPCR结果与RNA-seq数据的一致性好，证明RNA-seq分析结果具有可靠性。这说明猪链球菌应对氧化应激是一个涉及细菌多个途径和一系列基因表达变化的复杂过程。通过分析实验组和对照组之间DN13菌株的基因表达水平，发现在本研究中与抗氧化相关的差异表达基因的表达变化均与其功能一致，且均注释到催化活性、细胞结构体和结合这3个GO条目中，这说明转录组分析的数据可在整体上准确反映参与抗氧化应激基因表达水平的变化。
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