基于GBS构建玉米高密度遗传图谱及营养品质性状QTL定位

作者：赖国荣; 张静; 刘函; 董小妹; 赖锦盛; 黄亚群; 陈景堂; 郭晋杰

来源：农业生物技术学报, 2017, 25(09): 1400-1410.

• 玉米(Zea mays)
• 基于测序的基因分型技术
• 高密度遗传图谱
• 营养品质性状
• 数量性状位点

高密度遗传连锁图谱的构建可以为玉米遗传作图研究提高定位精度。本研究以玉米自交系X178和NX531为亲本,构建了包含150个株系的重组自交系(recombination inbred line,RIL)群体。基于测序的基因分型技术(genotyping-by-sequencing,GBS)获得基因型纯合的多态性SNP(single nucleotide polymorphism)位点,使用滑动窗口(sliding windows)的方法进行基因型分型,构建了总长为2 569 c M的高密度遗传图谱,标记间平均遗传距离为0.35 c M。为了验证图谱定位可靠性,结合RIL群体籽粒脂肪含量、赖氨酸含量、蛋白质含量和淀粉含量4个营养品质性状的表型数据,使用R/qtl软件包及复合区间作图模型进行QTL定位,共检测到20个营养品质性状相关QTL。本研究所构建的高密度遗传连锁图谱将为玉米农艺性状的遗传基础研究提供良好的基础,同时为玉米籽粒品质的育种改良提供一定的参考。

• 单位
  河北农业大学; 中国农业大学; 农业生物技术国家重点实验室