缢蛏5个群体遗传多样性和遗传分化的SNP分析

作者：滕爽爽; 胡高宇; 范建勋; 柴雪良; 肖国强^*

来源：水生生物学报, 2021, 45(04): 861-870.

• 缢蛏
• 单核苷酸多态性
• 遗传多样性
• 遗传分化

利用多态性SNP标记,采用SNaPShot方法分析了缢蛏(Sinonovacula constricta)5个群体(山东东营群体DY、浙江乐清群体YQ、福建云霄群体YX、广东湛江群体ZJ及广西钦州群体QZ)的遗传多样性和遗传结构。结果表明, DY、YQ、YX、ZJ和QZ的平均有效等位基因数(Ne)分别是1.754、1.555、1.558、1.533和1.519;平均香农指数(I)为0.605、0.501、0.502、0.489和0.471;平均观测杂合度(Ho)为0.317、0.282、0.282、0.265和0.285;平均期望杂合度(He)为0.423、0.336、0.338、0.325和0.313;平均最小等位基因频率(MAF)为0.336、0.241、0.238、0.234和0.229;缢蛏5个群体具有较高遗传多样性。STRUCTURE分析显示所有的缢蛏个体可以划分为5个聚类簇, 5个群体在每个聚类簇中占比为0.075—0.397,均未聚集到单个聚类簇中;AMOVA分析结果显示,群体间遗传分化系数(Fst)值为–0.0061—0.0829;群体两两之间遗传距离为0.0023—0.0537, Nei’遗传相似度为0.9477—0.9977; UPGMA聚类分析表明乐清群体和云霄群体聚为一支,湛江群体和钦州群体聚为一支,东营群体与其他4个群体遗传距离最远,单独为一支。群体遗传结构分析表明,群体间遗传变异主要来自群体内部,群体间具有较高的遗传相似度和较低的遗传分化,推测缢蛏在养殖过程中频繁的亲贝引种和苗种移养可能是导致群体遗传分化程度不高的主要原因。

• 单位
  浙江省海洋水产养殖研究所