新疆地区GIII.2型牛诺如病毒流行病学调查及ORF1基因遗传进化分析

作者：马志刚; 何琴; 施晨阳; 刘馨博; 郭雪萍; 吴静; 马英才; 苏战强; 钟旗; 姚刚; 马雪连^*

来源：中国预防兽医学报, 2022, 44(08): 888-902.

• 牛诺如病毒
• 感染情况
• ORF1基因
• 遗传进化分析

为调查牛诺如病毒（BNoV）在新疆不同地区牛场中的感染情况，本实验针对BNoV的RdRp基因设计特异性引物，采用RT-PCR方法对新疆乌鲁木齐、塔城、伊犁、喀什4个地区的7个牛场共230份牛粪便样品进行检测，并获得塔城地区一株BNoV开放阅读框1(ORF1)基因，对其进行遗传进化、同源性及基因重组分析。流行病学调查结果显示，新疆地区BNoV阳性率为17.83%(41/230)，其中塔城地区阳性率最高（60.00%,9/15）。对检测的BNoV ORF1基因进行遗传进化分析，结果显示，其属于GIII.2型BNoV，与中国四川地区OK032546.1病毒株相似性最高（94.6%），聚为一支；同源性分析结果显示，本研究中检测到的两株BNoV的ORF1基因序列之间的同源性为100%，均与OK032546.1病毒株相应基因序列同源性最高（96.6%）。ORF1编码的氨基酸序列分析显示两株BNoV ORF1与MZ573179.1病毒株同源性最高（98.35%），且与国内外其他GIII.2型病毒株同源性在76.1%以上。通过对ORF1基因重组分析，结果显示，本研究检测到的BNoV与国内外经典株ORF1基因无基因重组现象。本研究填补了新疆地区对BNoV基因序列研究的空白，为BNoV感染的防制提供了参考依据。

• 单位
  新疆畜牧科学院兽医研究所; 新疆农业大学