鮰爱德华菌密度感应系统LuxI/LuxR的克隆及生物信息学分析

作者：郭锦志; 马士杰; 韩先干; 付立霞^*

来源：安徽农业科学, 2023, 51(18): 107-114.

• 鮰爱德华菌
• 密度感应系统
• LuxI/LuxR
• 基因克隆
• 生物信息学

克隆鮰爱德华菌(Edwardsiella ictaluri)YCH株酰基高丝氨酸内酯(Acyl homoserine lactones, AHLs)合成酶(LuxI)和AHLs受体蛋白(LuxR)的全长基因，并对其进行生物信息学分析。序列分析结果显示，LuxI全长666 bp,共编码221个氨基酸；LuxR全长720 bp,编码239个氨基酸。构建LuxI/LuxR的系统发生树，结果显示，鮰爱德华菌LuxI/LuxR与迟缓爱德华菌(Edwardsiella tarda)、杀鱼爱德华菌(Edwardsiella piscicida)、保科爱德华菌(Edwardsiella hoshinae)等有较近亲缘关系。利用SWISS-Model软件，分别以1K4J.1.A(46.15%)和5l09.1.A(40.83%)蛋白作为模板对LuxI蛋白的8-189区域和LuxR蛋白2个功能结构域Pfam:Autoind＿bind(9～151氨基酸)和HTH＿LUXR(171～228氨基酸)进行分子模拟，其中LuxI结构域内有明显的“V”形疏水腔结构，LuxR的N-端结构域有α-β-α排列，C-端结构域内有螺旋—转角—螺旋结构。

• 单位
  中国农业科学院上海兽医研究所; 扬州大学