菠菜SoSWEET蛋白家族基因鉴定与表达分析

作者：杨蛟; 张力劼; 王雪美; 翁莉; 刘梓涵; 蔡晓锋^*

来源：上海师范大学学报(自然科学版), 2022, 51(06): 731-741.

• 菠菜
• SoSWEET蛋白家族
• 霜霉病
• 生物信息学分析

以现有菠菜基因组信息为基础，通过生物信息学方法筛选鉴定16个菠菜SoSWEET蛋白家族成员，命名为SoSWEET1～SoSWEET16.氨基酸残基数量在648～1 140之间，分子质量在54 070.32～95 868.64 u之间，理论等电点（pI）在5.06～5.19之间.亚细胞定位预测有6个SoSWEET蛋白定位于细胞膜，5个SoSWEET蛋白定位于内质网，5个SoSWEET蛋白定位于细胞膜、内质网.系统进化分析将菠菜SoSWEET蛋白家族分成4个亚族，在此基础上对基因结构、保守基序、顺式作用调控元件等进行分析.共鉴定了10个高度保守基序，其中所有菠菜SoSWEET蛋白都包含基序1,2和4，是构成菠菜SoSWEET蛋白中最高度保守的部分.所有菠菜SoSWEET蛋白家族成员都含MtN3＿slv和PQ-loop superfamily结构域.大多数SoSWEET蛋白家族的基因含有5个内含子.顺式作用元件预测结果表明，菠菜SoSWEET基因启动子上包含光响应、生长发育、植物激素响应和逆境胁迫响应等顺式作用元件.组织表达分析表明，所有SoSWEET基因在根、茎、叶和叶柄中都有表达，霜霉病胁迫处理后16个基因表现出不同响应变化.本研究为后续深入研究菠菜SoSWEET蛋白家族成员的功能提供了重要参考.

• 单位
  生命科学学院; 上海师范大学