海菜花ISSR-PCR反应体系的优化与引物筛选

作者:杨栋林; 罗慧蓉; 陈治秀; 廖文雪; 方轶男; 潘巍; 侯丛林; 吴荻; 尚常花*
来源:分子植物育种, 2022, 20(13): 4416-4424.
DOI:10.13271/j.mpb.020.004416

摘要

为建立海菜花ISSR-PCR最优反应体系并筛选出适宜的ISSR-PCR引物,本研究应用L16(34)正交设计试验和单因素实验,筛选ISSR-PCR反应体系中主要参数(引物, 2×Taq Master Mix,模板DNA)的最适浓度。结果表明,海菜花最适ISSR-PCR反应体系为引物0.22 ng, 2×Taq Master Mix 1.5 U/25μL、模板DNA24 ng。通过最优反应体系进行引物筛选,获得19条适宜海菜花扩增的ISSR引物,并利用10个地理居群的海菜花DNA对该体系进行验证。本研究对海菜花后续的遗传多样性、遗传图谱构建提供参考。

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