Graves病患者外周血单个核细胞中环状RNA表达谱分析

作者：王雪华; 彭辉勇; 朱樟伟; 邹君丽; 柳迎昭^*

来源：江苏大学学报(医学版), 2021, 31(06): 467-500.

DOI：10.13312/j.issn.1671-7783.y210028

• Graves病
• 环状RNA
• 二代高通量测序
• 生物标志物
• 外周血单个核细胞

目的:探讨Graves病患者外周血单个核细胞(PBMCs)中环状RNA(circRNA)的表达谱及其潜在的诊断价值。方法:选取5例Graves病患者和5例健康对照者,采用二代高通量测序技术分析PBMCs中circRNA表达谱。另选取40例Graves病患者和40例健康对照者验证差异表达的circRNA;根据CircInteractome数据库预测可能与差异表达的circRNA相结合的微小RNA(miRNA);运用生物信息学分析差异表达的circRNA潜在的生物学功能;ROC曲线分析差异表达的circRNA对Graves病的诊断价值。结果:二代高通量测序数据显示,与健康对照相比,Graves病患者PBMCs中circRNA有23 215个表达上调,13 695个表达下调,其中显著差异表达(差异倍数≥2,P≤0.05)的有669个,包括360个上调和309个下调的circRNA。实时荧光定量PCR验证显示hsacirc0114427、hsacirc0007470、hsacirc0048232、hsacirc0002672表达水平与高通量测序结果一致,且两组间差异具有统计学意义(P<0.01和P<0.05),hsacirc0039161和hsacirc0002600表达两组间无明显差异。GO富集分析显示,上调的circRNA与高分子代谢、细胞内膜结合细胞器、转移酶激活等过程关系密切。KEGG分析显示,差异表达的circRNA可能参与甲状腺激素信号、磷脂酰肌醇信号系统、非小细胞肺癌等相关信号通路。ROC曲线显示hsacirc0114427具有较大的曲线下面积。结论:Graves病患者PBMCs中存在明确差异表达的circRNA,hsacirc0114427可能与Graves病的发生发展有关。

• 单位
  江苏大学附属人民医院