巴西橡胶树核糖体蛋白S5基因的克隆及生物信息学分析

作者：李德军; 邓治; 陈春柳; 陈守才

来源：湖北农业科学, 2009, 48(12): 2931-2935.

DOI：10.3969/j.issn.0439-8114.2009.12.006

• 巴西橡胶树
• 核糖体蛋白S5
• 基因克隆
• 序列分析

核糖体蛋白S5是核糖体蛋白家族的重要成员,在核糖体中发挥重要作用。利用本实验室获得的部分序列设计引物,采用3'-RACE技术从巴西橡胶树胶乳中获得一个核糖体蛋白S5基因的完整阅读框,该基因编码209个氨基酸的多肽,含有一个典型的真核生物核糖体蛋白S5结构域。在HbRPS5氨基酸序列中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明HbRPS5属于混合型蛋白。对14个RPS5系统进化分析表明,巴西橡胶树的RPS5基因在进化上具有保守性,与植物类拟南芥的RPS5基因亲缘关系最近,而与人和酵母等亲缘关系相对较远。该基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础。

• 单位
  中国热带农业科学院橡胶研究所; 农业部