抗肿瘤药物FTY720对p53依赖的基因转录调控

作者：姚涵; 徐文彬; 王冬来^*

来源：基础医学与临床, 2021, 41(03): 311-317.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2021.03.001

• p53
• FTY720
• U2OS
• 基因表达调控
• 生物信息学分析

目的探究抗肿瘤药物FTY720是否参与p53依赖的基因表达调控,分析FTY720-p53轴潜在的生物学调控作用。方法在表达野生型p53的人骨肉瘤细胞系U2OS中利用CRISPR/Cas9技术构建p53敲除(p53-KO)的细胞株;将野生型或p53-KO的U2OS细胞给予FTY720处理,通过转录组测序(RNA-seq)结合基因功能富集分析表征p53依赖的差异表达基因及其潜在的生物学功能。结果获得U2OS p53-KO细胞株,筛选出220个FTY720作用下p53依赖的差异表达基因。这些基因主要在血小板活化、细胞趋化因子反应、Rho蛋白信号传导、多细胞生物体内平衡、黏蛋白型O-聚糖生物合成、细胞外基质(ECM)-受体相互作用、病毒蛋白质与细胞因子和细胞因子受体相互作用等生物学过程中起着调控作用。结论 p53的激活可能在FTY720抑制肿瘤进展的过程中起到一定作用。

• 单位
  北京协和医学院; 中国医学科学院基础医学研究所