基于生物信息学分析PRKCD在肝细胞癌组织中的表达及临床意义

作者：胡连涛; 邓文俊; 孙跞; 鹿士振; 李学斌; 黎楚豪; 王绎博; 王欣然; 李玥; 王伟群^*

来源：海南医学院学报, 2022, 28(14): 1088-1095.

DOI：10.13210/j.cnki.jhmu.20210823.004

• 蛋白激酶Cδ(PKCδ,PRKCD)
• 肝细胞癌
• 生物信息学分析
• 预后

目的：基于生物信息学分析蛋白激酶Cδ(PKCδ,PRKCD)在肝细胞癌组织中的表达及临床意义，以期为寻找肝细胞癌的临床诊疗潜在分子标志物和靶点提供参考。方法：利用The Cancer Genome Atlas(TCGA)和UCSC Xena平台获取肝细胞癌和癌旁组织中PRKCD的mRNA表达量和临床数据，比较PRKCD mRNA在两组样本中的表达差异；利用Human Protein Atlas数据库分析PRKCD蛋白在肝细胞癌和癌旁组织中的表达差异；利用TCGA分析PRKCD mRNA表达与肝细胞癌临床病理特征和预后的相关性；利用TCGA数据库对肝细胞癌中PRKCD表达进行GSEA富集分析，并从遗传和表观遗传学的观点分析PRKCD表达变化的原因。结果：PRKCD在肝细胞癌组织中的mRNA和蛋白质水平均显著高于癌旁组织；PRKCD表达与TNM分期、组织学级别、甲胎蛋白含量和患者生存状态相关，并且其表达水平具有一定的临床诊断准确性；Kaplan-Meier分析显示PRKCD低表达患者的预后显著优于高表达患者；单因素和多因素Cox回归分析显示，PRKCD是肝细胞癌患者独立预后因素，且TNM为Ⅲ和Ⅳ期生存曲线的风险比显著大于Ⅰ和Ⅱ期；GSEA分析显示PRKCD主要富集在细胞周期和DNA复制等过程，并与两者呈正相关性，且PRKCD主要参与了趋化因子、NOD样受体、PPAR、脂肪细胞因子和T细胞受体信号通路；遗传和表观遗传分析显示PRKCD表达水平与其基因的拷贝数呈正相关，但与其甲基化水平呈负相关。结论：PRKCD基因在肝细胞癌组织中表达上调，且其表达上调与患者预后不良具有显著相关性。

• 单位
  第一临床医学院; 佳木斯大学; 基础医学院