摘要

bHLH转录因子在植物生长发育过程发挥重要转录调控作用,在响应生物胁迫和非生物胁迫方面发挥重要功能。本研究在前期获得赪桐三代全长转录组数据的基础上,利用生物信息学方法对赪桐bHLH基因家族进行筛选与鉴定,对预测的蛋白质开展理化性质、结构域分析、系统进化关系分析、亚细胞定位预测、蛋白质二级结构分析等。结果表明,赪桐bHLH家族共有65个成员,其编码蛋白均具有亲水性;亚细胞定位预测显示主要分布在细胞核、叶绿体和细胞外间隙表达,其中96.9%蛋白在细胞核中表达。保守结构域分析显示,有58个编码蛋白同时含有2个bHLH转录因子保守基序,出现频率最高。蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,另外3.1%的蛋白具有跨膜结构。系统进化树分析表明,赪桐bHLH蛋白总体可分为9个亚族,而赪桐与拟南芥bHLH转录因子家族可聚类为21个亚族,且在第21亚族中包含10个赪桐bHLH蛋白,数量最多。本研究结果将为进一步探索和分析赪桐bHLH转录因子的功能奠定基础。