大白菜漆酶基因家族(BrLAC)全基因组鉴定与生物信息学

作者：王虹云; 李涛^*; 张丽莉; 姚建刚; 夏秀波; 曹守军; 周杨

来源：分子植物育种, 2018, 16(24): 7956-7964.

DOI：10.13271/j.mpb.016.007956

• 大白菜
• BrLAC
• 生物信息学
• 同源表达

本研究利用生物信息学方法对大白菜的漆酶(p-diphenol oxadise or laccase, LAC)基因家族成员、染色体定位、基因结构、进化树、氨基酸序列及同源表达情况进行了相关分析。结果显示,15个大白菜漆酶基因(BrLAC)家族成员分布于7条染色体上,部分基因存在串联复制现象;基因结构分析显示,该家族基因含2～6个内含子;亚细胞定位及跨膜结构分析表明,BrLAC无跨膜区或仅有一个很短的跨膜区域,主要定位于细胞外及周质;氨基酸序列分析结果表明BrLAC氨基酸序列均含有漆酶的3个典型保守结构域,4个铜离子结合位点;通过与拟南芥LAC进行系统发生分析,将其分为6个亚族;同源分析LAC在不同组织中的表达情况表明LAC在根系和果荚中的表达量较高,在花及叶片中的表达量较低。大白菜漆酶可能代替多酚氧化酶直接参与酶促褐变,值得深入研究。

• 单位
  山东省烟台市农业科学研究院; 烟台大学; 生命科学学院