LPS处理奶牛乳腺上皮细胞后外泌体中差异miRNA分析

作者:张天琦; 许浩天; 赵文苹; 李思妍; 连帅; 王建发*; 武瑞
来源:中国兽医学报, 2021, 41(12): 2438-2467.
DOI:10.16303/j.cnki.1005-4545.2021.12.22

摘要

为明确脂多糖(LPS)处理奶牛乳腺上皮细胞后外泌体中的差异微小核糖核酸(miRNA)及其靶基因特征,用超速离心法分别提取对照组和LPS刺激组乳腺上皮细胞外泌体,对所提取样品进行透射电镜观察,并对外泌体中miRNA进行高通量测序、注释、差异表达分析,以及差异miRNA的靶基因预测和靶基因生物功能和信号通路分析。结果发现,所分离外泌体直径在40~150 nm之间,呈典型的膜泡盘样结构;LPS刺激奶牛乳腺上皮细胞后外泌体中分拣的miRNA数量显著减少,bta-miR-125a、125b、205、451等21个miRNA显著上调,bta-miR-11987、11977、133a、2285aw等23个miRNA显著下调;预测的差异miRNA靶基因主要包括活化白细胞黏附分子、Ig样细胞黏附分子、免疫球蛋白基因超家族成员5等;差异miRNA靶基因分析表明所预测靶基因主要聚类于蛋白结合、丝裂原活化蛋白激酶、内吞、RAS、Th17细胞分化和调节机制、转录失调、miRNA等分子功能和信号通路。本研究为系统认识奶牛乳腺感染时乳腺上皮细胞外泌体功能提供了研究依据。