猪MyD88基因的克隆及其结构预测分析

作者：曾爽; 房永祥; 陈国华; 景志忠

来源：动物医学进展, 2010, (05): 1-5.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2010.05.027

• 猪MyD88基因
• 分子克隆
• 序列分析
• 结构预测 porcine mydoid differentiation factor 88(pMyD88)
• molecular cloning
• sequence analysis
• structure prediction

应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从猪的脾脏淋巴细胞中克隆了猪MyD88基因(pMyD88)。基因序列分析表明,克隆的pMyD88基因含一个完整的开放阅读框(ORF),大小为882 bp,共编码293个氨基酸,分子质量33.28 ku,A+T=41.38%,G+C=58.62%。DNA Star软件分析发现,与GenBank上登载的猪AB292176核苷酸和氨基酸序列同源性分别为99.5%和100%,与其他物种的核苷酸序列同源性均在80%以上,说明MyD88基因在各物种间相对保守,在遗传系统发生上亲缘关系密切。对猪MyD88蛋白分子的结构预测发现,α-螺旋占41.3%,伸展结构占1...

• 单位
  农业部; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 中国农业科学院兰州兽医研究所