猕猴桃病毒A和B在陕西省的分布、分子变异与基因组研究

作者：赵磊; 张元乐; 黄倩茹; 侯彩婷; 吴宽; 曹孟籍; 王乔春^*; 吴云锋^*

来源：园艺学报, 2020, 47(07): 1383-1390.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0760

• 猕猴桃
• 猕猴桃病毒A
• 猕猴桃病毒B
• 基因组
• 分子变异
• 病毒检测

系统调查了中国陕西省猕猴桃主产区周至、眉县、杨凌和汉中‘徐香’、‘海沃德’、‘华优’和‘秦美’猕猴桃上猕猴桃病毒A(Ac VA)和猕猴桃病毒B(Ac VB)的带毒率和分布情况。结果表明,Ac VA和Ac VB在4个产区均有广泛地分布和较高的带毒率。其中,Ac VA和Ac VB分别在杨凌(36.7%)和眉县(36.9%)有最高的带毒率。按照品种划分,Ac VA(32.3%)和Ac VB(32.9%)均在‘徐香’品种上有最高的带毒率。通过高通量测序与分析获得了Ac VA和Ac VB的基因组序列,其分别由7 654和7 454个核苷酸组成,与之前报道的TP7-93A和TP7-93B分离物对应的同源率分别为82.7%和78.5%。Ac VA和Ac VB外壳蛋白基因系统发育树显示,2种病毒分成2个组,存在较大的分子变异。

• 单位
  杨凌职业技术学院; 西南大学; 旱区作物逆境生物学国家重点实验室; 西北农林科技大学