藜麦种质资源遗传多样性SSR标记分析

作者：孙梦涵; 邢宝; 崔宏亮; 周帮伟; 张琴萍; 任贵兴; 秦培友^*

来源：植物遗传资源学报, 2021, 22(03): 625-637.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.20200911001

• 藜麦
• SSR标记
• 遗传多样性
• 聚类分析
• 群体结构

为研究藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)种质资源的遗传多样性,分析中国藜麦种质遗传背景,本研究利用65对简单重复序列(SSR)标记对163份藜麦种质和3份台湾红藜(Chenopodium formosanum Koidz.)种质进行分子标记,分析了该种质群体的多态性和亲缘关系。数据显示,65对SSR标记在166份供试种质材料中检测到327个等位位点,平均每个标记5.031个等位位点,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.387和0.588,平均多态性信息含量为0.524。用类平均法将166份材料聚为3个类群,其中第Ⅰ类群仅包括3份台湾红藜,第Ⅱ类群包括以来源于美国国家种质库和智利种质为主的103份种质材料,第Ⅲ类群包括以来源于玻利维亚和秘鲁种质为主的60份种质材料。群体结构分析和主成分分析将藜麦群体划分为2个亚群,亚群之间有基因交流。结果表明,玻利维亚和秘鲁种质与美国和智利种质的遗传信息存在明显区分,来自中国青海和中国云南的藜麦种质在亲缘关系上更接近安第斯高原型,来自中国河北、中国山西的藜麦种质更接近智利低海拔型。台湾红藜为中国台湾本土种质。藜麦种质的SSR标记遗传多样性分析,能够推测其进化途径和遗传背景,为藜麦的生物学研究和育种提供科学依据。

• 单位
  中国农业科学院作物科学研究所; 东北师范大学; 成都大学