OATP1B1蛋白结构与功能的生物信息学分析

作者：刘嘉伟

来源：分子植物育种, 2021, 1-12.

• OATP1B1蛋白
• 生物信息学
• 理化性质
• 蛋白质修饰位点
• 蛋白相互作用

有机阴离子转运多肽1B1 (OATP1B1)是有机阴离子转运多肽OATP超家族的膜转运蛋白，在药物的吸收、分布、代谢、排泄过程中发挥着重要的作用。OATP1B1膜蛋白的氨基酸序列从美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information， NCBI)数据库中检索，运用生物信息学在线分析软件对OATP1B1蛋白的理化性质、保守结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点及相互作用蛋白拓扑网络进行了预测分析。结果表明，OATP1B1为疏水性蛋白，分子中存在12个跨膜结构域，无信号肽序列，有多个磷酸化位点和糖基化位点，是高度磷酸化的糖蛋白。蛋白质二级结构软件在线预测显示，无规则卷曲占46.16%，α螺旋占34.15%，延伸链占17.66%，β转角占2.03%。对其相互作用蛋白的拓扑网络预测发现，OATP1B1主要参与胆汁酸，胆汁盐，甲状腺激素等的转运，与药物转运进肝细胞密切相关，另外还参与胆汁分泌。本研究可为研究OATP1B1的药物转运、代谢、排泄机制和联合用药提供理论基础。

• 单位
  南昌大学