基于分子对接技术筛选水稻黄单胞菌CSE抑制剂

作者：刘学贵; 何文飞; 高品一; 李丹琦; 刘长风^*

来源：福建农林大学学报（自然科学版）, 2023, 52(02): 141-148.

DOI：10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2023.02.001

• 水稻黄单胞菌
• 胱硫醚-γ-裂解酶
• 吲哚类生物碱
• 分子对接
• 耐药性
• 靶向

由水稻黄单胞菌(Xoo)引起的水稻白叶枯病通常会给水稻带来严重危害；由于抗生素类药物的广泛使用，Xoo出现了耐药性.细菌通过体内的胱硫醚-γ-裂解酶(CSE)产生内源性硫化氢(H2S)是其增强耐药性的重要方式.为降低Xoo的耐药性，基于分子对接技术，以Xoo体内的CSE为靶标，从68个吲哚类生物碱中虚拟筛选CSE抑制剂.结果显示，化合物1-hydroxyrutaecarpine、indican和strictosamide对靶蛋白的亲和力分别为-36.40、-35.15和-34.30 kJ·mol-1,均低于参考化合物NL3(-33.89 kJ·mol-1).上述化合物的部分结构均能嵌入蛋白活性空腔并与周围氨基酸产生较为稳定的相互作用.由此推测化合物1-hydroxyrutaecarpine、indican和strictosamide可能会对Xoo体内的CSE产生一定的抑制作用.

• 单位
  生物工程学院; 沈阳化工大学