崇明东滩夏季沉积物厌氧氨氧化菌群落结构与空间分布特征

作者：郑艳玲; 侯立军; 陆敏; 谢冰; 刘敏; 李勇; 赵慧

来源：环境科学, 2012, (03): 992-999.

DOI：10.13227/j.hjkx.2012.03.051

• 厌氧氨氧化
• 崇明东滩
• 16SrDNA
• PCR
• 克隆
• 长江口 Anaerobic Ammonium Oxidation(ANAMMOX)
• Chongming Dongtan
• 16S rDNA
• PCR
• clone
• Yangtze Estuary

为探索长江口崇明东滩表层沉积物中是否存在厌氧氨氧化菌以及厌氧氨氧化菌的群落结构与空间分布特征,以崇明东滩高、中、低潮滩夏季表层沉积物中总DNA为模板,PCR扩增沉积物样品中厌氧氨氧化菌特异性16S rDNA片段,通过克隆、测序,构建相应基因文库,将文库中有效克隆序列分别提交到GenBank中进行相似序列搜索,并利用MEGA5绘制系统发育树.分析结果发现,克隆序列CM-L-7和CM-L-18与已发现厌氧氨氧化菌Candidatus"Scalindua sp."同源性达98%,CM-L-13与Candidatus"Scalindua wagneri"同源性达94%,CM-M-6与Candidatu...

• 单位
  上海植物园; 华东师范大学; 河口海岸学国家重点实验室