基于多数据域描述的转录因子结合位点识别

作者：陈鸣; 薛慧君; 熊赟; 朱扬勇

来源：计算机应用与软件, 2011, (06): 1-4+42.

• 多任务学习
• 转录因子结合位点
• 多数据域描述
• 核方法 Multi-task learning Transcription factor binding sites Multiple data domain description Kernel methods

转录因子结合位点的识别对于理解转录调控机制起着重要作用,也是后基因组时代面临的巨大挑战之一。提出一个基于多任务学习的转录因子位点的识别方法。首先建立一个基于多任务学习理论的多数据域描述模型,然后结合核方法设计转录因子结合位点多分类识别算法。最后对取自于TRANSFAC数据库的真实数据进行交叉验证测试。实验结果表明该方法能充分地利用稀缺的训练样本,有效地捕获不同类别间的联系,从而获得了较高的预测准确率。

• 单位
  内蒙古电子信息职业技术学院; 复旦大学