尼罗罗非鱼MYF6基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联分析

作者：高风英; 佟延南; 刘志刚; 曹建萌; 王淼; 衣萌萌; 可小丽^*; 卢迈新; 朱海^*

来源：农业生物技术学报, 2023, 1-21.

• 尼罗罗非鱼
• 肌源性因子6 (MYF6)
• SNP
• 双倍型
• 生长性状

肌源性因子6 (myogenic factors 6, MYF6)对骨骼肌的起始、发育以及表型维持是不可或缺的，是生长相关性状的候选基因。本研究拟确定MYF6基因的SNPs，并评估这些多态性是否与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的生长性状相关。首先利用PCR和Sanger测序筛选MYF6基因SNPs，通过Sanger测序及SNaPshot方法确认，结果从MYF6基因共筛选到61个SNP位点。进一步从61个位点中挑选多态性>3%的36个位点，在广东高要亲代群体中利用Sanger测序及SNaPshot方法进行分型分析，并利用SPSS 19软件的一般线性模型(general linear model, GLM)和单因素方差分析(one-way analysis of variance,ANOVA)进行SNP位点与生长性状关联分析。结果显示，36个位点中有2个与高要亲代群体体重相关，4个与全长相关，7个与头长相关，2个与体高相关。将这些生长相关位点在高要子代及番禺群体中进行分型验证，结果显示，在高要子代中，S7插入缺失位点(5620-GAGACGGAGA5629)与体重、体长和体高相关，S24 (C-7388G)位点与体重、体高和体厚相关，S56 (A-11815C)位点与体重、全长、体长、头长、体高和体厚均相关；在番禺群体中获得体重相关SNP位点2个，体长和全长相关位点1个、头长相关位点1个，体厚相关位点2个。将上述与高要子代及番禺群体生长性状相关的位点在海南群体中进一步验证，在雄性群体中获得体重相关位点1个(S29)。双倍型与各群体生长性状关联分析表明，在高要亲代、高要子代以及番禺群体中获得体重相关双倍型各1个。本研究为罗非鱼生长性状改善和选育提供有效的分子标记。

• 单位
  海南省海洋与渔业科学院; 中国水产科学研究院珠江水产研究所; 农业部