我国兔出血症病毒2型全基因组测序与遗传进化分析

作者：于吉锋; 肖璐; 周泷; 谢晶; 曹冶; 叶勇刚; 李兴玉; 潘梦; 叶健强; 魏甬; 张先惠; 康润敏^*; 林毅^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (08): 73-77.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2020.05.0382

• 兔出血症病毒2型
• 全基因
• VP60基因
• 遗传进化
• 防控

为了研究兔出血症病毒2型(RHDV2)的基因组特性及遗传进化关系,试验对四川省某兔场死亡兔的组织病料进行RHDV2鉴定,采用RT-PCR方法扩增RHDV2全基因组分段序列,经DNAStar拼接获得病毒全基因组序列;采用MegAlign软件将分离株的全基因组、NSPs、VP60及VP10基因核苷酸序列和氨基酸序列与经典RHDV、RHDVa、RHDV2(RHDVb/GI.2)株进行了比对分析,并基于GenBank中44株RHDV的VP60基因构建分离株的系统发育树。结果表明:从病料组织中鉴定到RHDV2型毒株,命名为RHDV2-CHN/SC2020株,RHDV2-CHN/SC2020株与经典RHDV株、RHDVa株和RHDV2(RHDVb/GI.2)株的核苷酸序列相似性分别为84.6%～84.9%、83.4%～83.8%和92.0%～98.2%,与RHDV2型的相似性最高;RHDV2-CHN/SC2020株与荷兰株(RHDV2-NL2016)处于同一分支,亲缘关系最近。说明RHDV2已经传入我国,而遗传关系证实该病可能是从欧洲国家荷兰引种传入。

• 单位
  四川省畜牧科学研究院; 西南民族大学