畜禽长链非编码RNA的功能及其研究方法

作者：陆启荣; 刘孟轲; 李丽; 程古月; 郝海红; 王旭; 戴梦红; 袁宗辉

来源：中国畜牧兽医, 2016, 43(09): 2425-2434.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.09.030

• 长链非编码RNA
• 畜禽
• 生物学功能
• 研究方法

长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,不具有编码蛋白质的能力,主要参与脂肪代谢、肌肉发育、胚胎发育、性别决定与分化等多种生物过程和疾病的调控。在LncRNA研究中,研究方法的建立和应用起着至关重要的作用。作者简述了LncRNA的生物学特性和生物学功能,重点介绍了LncRNA的主要研究方法:基因芯片、RNA-seq、Northern blotting、荧光原位杂交(FISH)、实时荧光定量PCR、RNA结构平行分析(PARS)、快速预测RNA和蛋白质相互作用(CatRAPID)等,同时介绍了LncRNA与DNA、RNA及蛋白质的相互作用的方法:RNA-pulldown、RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)、光活性增强的核糖核苷交联和免疫共沉淀(PAR-CLIP)、RNA反义纯化(RAP)、RNA纯化的染色质分离(CHIRP)及RNA靶标的捕获杂交分析(CHART)、交联,连接以及混合测序(CLASH),为畜禽动物中LncRNA的研究提供借鉴。

• 单位
  华中农业大学; 农业部