科技评价改革是推进科技体制改革的重要举措,科研机构评价是科技评价的重要组成部分。文章介绍了国外科研机构评价的典型做法和中国农业科学院以量化为主的研究所评价体系的设计,总结了研究所评价的实施效果,分析了存在的问题,提出了重视科研导向作用、科研评价导向要与发展目标相一致、把握新时期的新导向、重视评价分析等一系列优化科研机构评价的建议。