3株临床分离的猪流行性腹泻病毒S基因克隆及序列分析

作者：张辛铭; 杨顺利; 马雪婷; 曹钰莹; 何雪阳; 蔡建平^*; 尹双辉^*

来源：动物医学进展, 2020, 41(07): 16-20.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2020.07.004

• 猪流行性腹泻病毒
• S基因
• 生物信息学分析
• 遗传变异

对临床分离鉴定的3株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的S基因进行克隆及序列分析,对丰富我国PEDV的遗传衍化特征具有重要意义。S基因序列分析发现,JX18毒株与CV777亲缘关系较近,核苷酸同源性为99.71%,氨基酸同源性95.7%,属于G1-b进化分支。JX18毒株与CV777经典毒株S蛋白氨基酸序列相比较,不存在氨基酸的插入或缺失,在中和表位区及已鉴定抗原表位区仅有一处氨基酸突变。SD18、JingTai18与PEDV CV777亲缘关系较远,核苷酸同源性分别为93.64%和92.64%,S蛋白氨基酸序列同源性分别为93%和93.5%。SD18和JingTai18位于G2-b进化分支。SD18与JingTai18株与CV777经典毒株相比,S蛋白氨基酸序列中存在插入缺失及多位点的氨基酸突变。研究结果为进一步了解我国PEDV流行及变异情况提供了数据支持。

• 单位
  江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心; 中国农业科学院兰州兽医研究所