宏基因组二代测序在非HIV感染型肺孢子菌肺炎中的应用研究

作者：陈佳怡; 梁晓; 夏铵冬; 杨芸; 袁兵; 耿嘉蔚^*

来源：重庆医学, 2023, 52(01): 91-96.

• 肺孢子菌肺炎
• 耶氏肺孢子菌
• 宏基因组二代测序

目的 分析宏基因组二代测序(mNGS)在非人类免疫缺陷病毒(HIV)感染型肺孢子菌肺炎(PJP)病原学诊断中的价值和特点。方法 选取2019年4月至2021年1月在该院收治的18例非HIV感染型PJP患者，收集mNGS结果及临床资料，采用SPSS25.0进行统计分析，两组间比较采用Mann-Whitney U检验，测序数据与部分临床指标进行Spearman相关分析。结果 18例PJP患者送检16例支气管肺泡灌洗液(BALF)和2例血标本mNGS中均检出Pj序列，17例标本Pj序列相对丰度在85%以上，Pj序列数在所有微生物种间排名1～14;未发现Pj序列数与发病时间、氧合指数、CD4+T淋巴细胞计数相关(rs=-0.131,-0.129,-0.040,P>0.05),与是否经验性抗Pj治疗(P=0.158)及是否发生院内死亡(P=0.426)不相关。所有BALF中均检出细菌序列并报告了可疑致病菌，血标本中未检出细菌序列；14例检出病毒序列，最常见为人类β疱疹病毒5型(9例)。所用患者接受磺胺甲噁唑/甲氧苄啶或联用棘白菌素类药物抗Pj治疗，治疗后影像学改善明显，3例发生院内死亡。结论 在非HIV感染型PJP病例中mNGS有良好的检测能力，条件允许时尽量选择下呼吸道标本送检以获得更全面的病原学信息。

• 单位
  昆明理工大学; 云南省第一人民医院