科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
为探究脱水素（dehydrin,DHN）蛋白与晚采鸭梨（Pyrus bretschneideri Rehd.）果心褐变之间的关系，基于生物信息学方法对鸭梨PbDHN3基因进行鉴定和特性分析，并分析急速降温和缓慢降温条件下晚采鸭梨果心褐变发生过程中PbDHN3基因的表达模式。结果表明，PbDHN3开放阅读框564 bp，编码187个氨基酸，且具有DHN的Dehydrin superfamily保守结构域，含有2个Y片段、1个S片段、3个K片段，属于Y2SK3型DHN。生物信息学分析表明Pb DHN3分子质量19.77 kDa，等电点7.98，为亲水性稳定蛋白；二级结构包含α-螺旋、无规卷曲、延伸链和β-转角，且定位于细胞核，不含信号肽与跨膜结构，为非分泌蛋白。同源性分析结果表明Pb DHN3与苹果等5种植物的DHN相似性达到89.74%以上，系统发育分析显示Pb DHN3和P. ussuriensis×P. communis的DHN亲缘关系最近。启动子分析结果表明PbDHN3含有基本启动子元件和其他顺式作用元件，与陆地棉GhDHN1及小麦TaDHN2启动子区预测结果一致，都包含激素响应元件、光响应元件等。实时聚合酶链式反应分析结果表明，急速降温条件下鸭梨果心部位DHN3基因在褐变过程中呈显著上调表达，与果心褐变紧密相关，为进一步探究该基因的功能，明确鸭梨果心褐变发生机制提供理论依据。
- 单位
