水稻小粒突变体smg2的表型鉴定和候选基因分析

作者：朱洪慧; 李映姿; 王成洋; 高远卓; 林泓; 晏紫仪; 李云峰^*

来源：西南大学学报(自然科学版), 2023, 45(01): 2-11.

DOI：10.13718/j.cnki.xdzk.2023.01.001

• 水稻
• 籽粒
• 颖壳发育
• 基因定位

水稻产量是由单位面积有效穗数、每穗粒数以及千粒质量决定的，籽粒形态可以决定千粒质量进而影响水稻产量.报道了一个与水稻籽粒形态发育相关的突变体，来源于籼稻保持系西大1B的甲基磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate, EMS)诱变群体.该突变体表现为由细胞扩展和细胞增殖异常导致的籽粒变小，暂命名为水稻小粒突变体(small grain 2,smg2).遗传分析表明：smg2突变体性状受1对隐性单基因控制，利用群体分离分析法(bulked segregation analysis, BSA)将SMG2基因定位在第1染色体IN/DEL标记A-0.85和A-1.05之间，物理距离200 kb,在定位区间内含注释基因28个. PCR测序发现其中编号为LOC＿Os01g02890的基因中第1个外显子的第153位碱基发生了单碱基缺失，造成编码框移码突变，从而导致蛋白翻译提前终止.因此，将LOC＿Os01g02890暂定为SMG2的候选基因.

• 单位
  西南大学