基于ITS2序列的黔产金线莲及其常见易混品分子鉴定研究

作者:黄哲; 杨烨*; 王世清; 党友超; 王锦
来源:现代中药研究与实践, 2023, 37(04): 11-15.
DOI:10.13728/j.1673-6427.2023.04.003

摘要

目的 对黔产金线莲及其常见易混品进行分子鉴定。方法 以ITS2序列为模版,对所收集的西南齿唇兰Anoectochilus elwesii、兴仁金线兰Anoectochilus xingrenensis、植物斑叶兰Goodyera schlechtendaliana等5种植物样品进行ITS2序列扩增及测序,同时在GenBank下载台湾金线莲Anoectochilus formosanus、小斑叶兰Goodyera repens等共6种相关植物ITS2序列,采用MEGAX6.4软件确定ITS2序列的GC含量,基于K2P模型计算种内和种间遗传距离,构建NJ系统发育树,ITS2 database在线分析二级结构,研究ITS2条形码序列对金线莲的鉴别效果。结果 金线莲的ITS2序列长度在329 bp,种内距离为0.001 8。而金线莲与兴仁金线兰、西南齿唇兰、银线莲、斑叶兰、小斑叶兰的最小种间距离为0.038 8,最大种间距离为0.109 9,表明金线莲的种内平均K2P遗传距离远小于种间遗传距离,并已达到序列差异的标准阈值。构建的邻接树显示金线莲单独聚成一支,与其他植物种类区分明显。结论 建立的鉴定方法简便,结果准确,能有效区分金线莲及其常见易混品植物。

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