2008～2014年中国6省市流行的人呼吸道合胞病毒B亚型G蛋白编码基因特征分析

作者：宋金华; 王慧玲; 石晶; 崔爱利; 杜佳; 杨子峰; 孙利伟; 张蕾; 张红; 张燕^*; 许文波^*

来源：病毒学报, 2019, 35(02): 211-219.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003520

• 人呼吸道合胞病毒B亚型(HRSV B)
• G蛋白
• 氨基酸
• 变异

人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是引起婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体之一。HRSV粘附蛋白(Attachment glycoprotein,G)是病毒膜表面糖蛋白,介导保护性免疫,是抗HRSV抗体和疫苗等的研究热点之一。为研究2008～2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因的基因特征,于2008～2014年收集的363份HRSV阳性临床标本或病毒株中挑选89份代表株进行G蛋白编码基因全长核苷酸序列的扩增和测序,使用Sequencher 5.0进行序列的编辑,使用MEGA 5.0进行序列比对和亲缘关系进化树构建以及氨基酸变异分析。89份代表株分别挑选自中国北京、吉林、广东、河北、湖南、陕西6省市发热呼吸道感染患者鼻咽拭子或病毒分离株,基因型包括BA9、BA10、BAc、BA、CB1及SAB4,覆盖我国近年流行的优势基因型。亲缘关系分析显示,89株代表株可以分为6个分支,同一基因型G蛋白编码基因核苷酸序列荟聚为一个分支;89份代表株之间的核苷酸(氨基酸)遗传距离为0.03(0.04),与原型株CH-18537株的核苷酸(氨基酸)遗传距离为0.08～0.10(0.14～0.18),其中B5分支与原型株的核苷酸(氨基酸)遗传距离最远为0.10(0.18);氨基酸变异主要在第二高变区,其次为第一高变区。在中心保守区(aa164～176)以及CX3C模序区,89条HRSV B亚型G蛋白编码基因氨基酸序列与原型株CH-18537株一致。本研究表明2008～2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因变异较多,但在中心保守区和CX3C模序区保守,本研究为我国HRSV的病毒学研究提供了基础科学数据。

• 单位
  陕西省疾病预防控制中心; 呼吸疾病国家重点实验室; 安徽理工大学; 广州医科大学; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 广州呼吸疾病研究所; 湖南省疾病预防控制中心; 长春市儿童医院