脑胶质瘤中miR-29b-3p核心靶基因的鉴定与分析

作者：卓胜华; 羊良旺; 陈申波; 张金本; 张召腾; 李争争; 杨堃^*

来源：海南医学院学报, 2022, 28(04): 258-268.

DOI：10.13210/j.cnki.jhmu.20201029.001

• 脑胶质瘤
• miR-29b-3p
• 靶基因
• 预后
• 生物信息学

目的：探讨miR-29b-3p在脑胶质瘤中的核心靶基因，并分析核心靶基因的临床意义。方法：采用生物信息学分析方法预测、筛选miR-29b-3p的靶基因；使用STRING、Cytoscape软件分析靶基因的蛋白间互相作用（protein-protein interaction,PPI）；用GEPIA、CGGA分析其在胶质瘤中的不同状态下的表达差异及生存预后，单因素、多因素Cox比例风险回归模型分析影响预后的独立因素。结果：通过LinkedOmics、miRDB、miRTarBase、TargetScan和starbase数据库预测出22个miR-29b-3p的靶基因，通过构建PPI网络，去除未参与网络关系的基因，综合GEPIA与CGGA数据库分析，剔除COL2A1、DNMT3A和DNMT3B，进一步通过多因素Cox比例风险回归模型分析，最终确定3个核心靶基因：SERPINH1、LOXL2、CDK6。结论：生物信息学分析显示miR-29b-3p在脑胶质瘤中靶向SERPINH1、LOXL2、CDK6基因，各基因的表达量在正常脑组织与肿瘤组织间、肿瘤不同级别间、IDH突变状态和1p/19q共缺失状态下存在差异，其高表达对总生存预后、无复发生存预后存在不良影响，且可作为独立预后因素。

• 单位
  海南医学院第一附属医院